De Raad van Bestuur telt veertien leden, benoemd voor een termijn van zes jaar. Hij controleert het directiecomité. De comités voor strategie, audit en bezoldiging ondersteunen de raad.
Het directiecomité staat in voor het dagelijkse bestuur van de Nationale Loterij. Er zijn vijf directeurs, onder leiding van de gedelegeerd bestuurder.
Sinds 2006 werd er bij de Nationale Loterij een Hoge Raad voor Ethiek van loterij- en kansspelen opgericht, dat moet nagaan of de strategie van de Nationale Loterij in overeenstemming is met de standaarden die de Europese Loterijenvereniging heeft vastgelegd inzake Verantwoord Spel. Daarover moet het Comité Verantwoord Spel adviezen verstrekken aan de Raad van Bestuur.
De hoge raad bestaat uit 9 leden: de Voorzitster, 4 externe deskundigen, en 4 personeelsleden van de Nationale Loterij. De externe deskundigen zijn wetenschappers of mensen met een ruime ervaring en expertise in de sociologische, psychologische en medische aspecten van het spelgedrag, zowel op het vlak van de consumentenbescherming als op het vlak van de veiligheid in de loterij- en kansspelsector.
